Teito Klein ist ein junger Student an der Militärakademie Barsburg, der mit seinem besten Freund Mikage im selben Wohnheim wohnt. Sie bereiten sich mit ihren Fähigkeiten, dem Zaiphon, auf ihr Abschlussexamen vor. Teito sieht eine Vision über ein dunkles Geheimnis aus seiner Vergangenheit (an das er sich nicht erinnern kann) und versucht, Ayanami, den Mörder seines Vaters, zu ermorden, wird aber gefangen genommen und in eine Zelle gesperrt. Er will alleine fliehen, doch als Mikage in seiner Zelle eintrifft, um ihn zu retten, gelingt es ihm, mit Hilfe von Mikage zu fliehen und aus der Akademie auszubrechen.